Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNRD1Q9P1U0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms