Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNKQ9P0W0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms