Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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SH3BP4Q9P0V3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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