Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KCMF1Q9P0J7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms