Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALKBH4Q9NXW9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms