Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC4BQ9NT99 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4BQ9NT99 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms