Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EMILIN3Q9NT22 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EMILIN3Q9NT22 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms