Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRMS1Q9HCU9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRMS1Q9HCU9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms