Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP6Q9GZR1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP6Q9GZR1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms