Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2OQ9C0C9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2OQ9C0C9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms