Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRCC1Q9C099 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRCC1Q9C099 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms