Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SHANK3Q9BYB0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK3Q9BYB0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHANK3Q9BYB0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms