Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM43Q9BTV4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM43Q9BTV4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms