Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM42Q9BTD8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBM42Q9BTD8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms