Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEC22CQ9BRL7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC22CQ9BRL7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms