Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
JSRP1Q96MG2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
JSRP1Q96MG2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms