Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAPNS2Q96L46 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPNS2Q96L46 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms