Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLMNQ96JQ2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLMNQ96JQ2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms