Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEURL4Q96JN8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEURL4Q96JN8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms