Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP36Q96EU6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms