Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C12orf43Q96C57 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms