Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TAF4BQ92750 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF4BQ92750 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms