Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGDCC4Q8TDY8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGDCC4Q8TDY8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms