Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HELQQ8TDG4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HELQQ8TDG4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms