Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CARMIL3Q8ND23 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARMIL3Q8ND23 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms