Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC33Q8N5R6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms