Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU1Q7Z7A3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU1Q7Z7A3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms