Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms