Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q71RC1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q71RC1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q71RC1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q71RC1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q71RC1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms