Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYDE1Q6ZW31 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms