Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
UBR3Q6ZT12 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBR3Q6ZT12 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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