Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP12Q6UXS9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms