Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC171Q6TFL3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms