Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LLGL2Q6P1M3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LLGL2Q6P1M3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms