Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF3Q5VWG9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms