Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF38BQ5VTL8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF38BQ5VTL8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms