Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM78BQ5VT40 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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