Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP188Q5SRE5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP188Q5SRE5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms