Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC158Q5M9N0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC158Q5M9N0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms