Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A3Q5K4L6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms