Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q56UQ5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q56UQ5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q56UQ5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms