Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL12Q53G59 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms