Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C4orf17Q53FE4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C4orf17Q53FE4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms