Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UVSSAQ2YD98 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms