Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTPRNQ16849 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRNQ16849 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRNQ16849 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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