Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
UPP1Q16831 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
UPP1Q16831 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms