Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAMA3Q16787 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMA3Q16787 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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