Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
FOXD1Q16676 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOXD1Q16676 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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