Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACKR1Q16570 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACKR1Q16570 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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