Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NTRK3Q16288 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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